Henrik Nielsen
Professor MSO
- Udgivet
Knock-Down of a Novel snoRNA in Tetrahymena Reveals a Dual Role in 5.8S rRNA Processing and Generation of a 26S rRNA Fragment
Andersen, Kasper Langebjerg & Nielsen, Henrik, 2018, I: Biomolecules. 8, 4, 19 s., 128.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Accumulation of Stable Full-Length Circular Group I Intron RNAs during Heat-Shock
Andersen, Kasper Langebjerg, Beckert, B., Masquida, B., Johansen, S. D. & Nielsen, Henrik, nov. 2016, I: Molecules. 21, 11, 18 s., 1451.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Experimental identification and analysis of macronuclear non-coding RNAs from the ciliate Tetrahymena thermophila
Andersen, Kasper Langebjerg & Nielsen, Henrik, 1 feb. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 3, s. 1267-81Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
The RNA helicase Dbp7 promotes domain V/VI compaction and stabilization of inter-domain interactions during early 60S assembly
Aquino, G. R. R., Hackert, P., Krogh, Nicolai, Pan, K. T., Jaafar, M., Henras, A. K., Nielsen, Henrik, Urlaub, H., Bohnsack, K. E. & Bohnsack, M. T., 2021, I: Nature Communications. 12, 6152.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RNA helicase-mediated regulation of snoRNP dynamics on pre-ribosomes and rRNA 2'-O-methylation
Aquino, G. R. R., Krogh, Nicolai, Hackert, P., Martin, R., Gallesio, J. D., van Nues, R. W., Schneider, C., Watkins, N. J., Nielsen, Henrik, Bohnsack, K. E. & Bohnsack, M. T., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, 7, s. 4066-4084 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular modelling of the GIR1 branching ribozyme gives new insight into evolution of structurally related ribozymes.
Beckert, B. D., Nielsen, Henrik, Einvik, C., Johansen, S. D., Westhof, E. & Masquida, B., 2008, I: EMBO Journal. 27, 4, s. 667-78 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The small Cajal body-specific RNA 15 (SCARNA15) directs p53 and redox homeostasis via selective splicing in cancer cells
Beneventi, G., Munita, R., Cao Thi Ngoc, P., Madej, M., Cieśla, M., Muthukumar, S., Krogh, Nicolai, Nielsen, Henrik, Swaminathan, V. & Bellodi, C., 2021, I: NAR Cancer. 3, 3, zcab026.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Intermolecular interaction between a branching ribozyme and associated homing endonuclease mRNA
Birgisdottir, A. B., Nielsen, Henrik, Beckert, B., Masquida, B. & Johansen, S. D., 1 apr. 2011, I: Journal of Biological Chemistry. 392, 6, s. 491-9 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The 23S Ribosomal RNA From Pyrococcus furiosus Is Circularly Permuted
Birkedal, U., Beckert, B., Wilson, D. N. & Nielsen, Henrik, 2020, I: Frontiers in Microbiology. 11, 582022.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Methods for Determination of 2′-O-Me in RNA
Birkedal, U., Krogh, Nicolai, Andersen, Kasper Langebjerg & Nielsen, Henrik, 30 jul. 2016, Modified Nucleic Acids in Biology and Medicine. Jurga, S., Erdmann, V. A. & Barciszewski, J. (red.). switzerland: Springer Science+Business Media, s. 187-205 (RNA Technologies).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Profiling of Ribose Methylations in RNA by High-Throughput Sequencing
Birkedal, U., Christensen-Dalsgaard, M., Krogh, Nicolai, Radhakrishnan, S., Gorodkin, Jan & Nielsen, Henrik, 7 jan. 2015, I: Angewandte Chemie (International ed. in English). 54, 2, s. 451-455 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Making ends meet: a universal driver of large ribosomal subunit biogenesis
Bohnsack, K. E., Henras, A. K., Nielsen, Henrik & Bohnsack, M. T., 2023, I: Trends in Biochemical Sciences. 48, 3, s. 213-215Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fractional 2'-O-methylation in the ribosomal RNA of Dictyostelium discoideum supports ribosome heterogeneity in Amoebozoa
Diesend, J., Birkedal, U., Kjellin, J., Zhang, J., Jablonski, K. P., Söderbom, F., Nielsen, Henrik & Hammann, C., 2022, I: Scientific Reports. 12, 1952.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Group I-like ribozymes with a novel core organization perform obligate sequential hydrolytic cleavages at two processing sites
Einvik, C., Nielsen, Henrik, Westhof, E., Michel, F. & Johansen, S., 1998, I: RNA: A publication of the RNA Society. 4, 5, s. 530-41 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Flanking sequences with an essential role in hydrolysis of a self-cleaving group I-like ribozyme
Einvik, C., Nielsen, Henrik, Nour, R. & Johansen, S., 2000, I: Nucleic Acids Research. 28, 10, s. 2194-200 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Demonstration of circulating immune complexes by the indirect leucocyte phagocytosis test in chronic inflammatory bowel disease. Relation to results of a standard complement consumption assay
Elmgreen, J., Wiik, A., Nielsen, Henrik & Nielsen, Ole Haagen, 1985, I: Acta Medica Scandinavica. 218, 1, s. 73-78 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Locating proteins in the cell using TargetP, SignalP and related tools
Emanuelsson, O., Brunak, Søren, von Heijne, G. & Nielsen, Henrik, 2007, I: Nature Protocols (Online). 2, 4, s. 953-71 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparison of primary and secondary 26S rRNA structures in two Tetrahymena species: evidence for a strong evolutionary and structural constraint in expansion segments
Engberg, J., Nielsen, Henrik, Lenaers, G., Murayama, O., Fujitani, H. & Higashinakagawa, T., 1990, I: Journal of Molecular Evolution. 30, 6, s. 514-21 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complete sequence of the extrachromosomal rDNA molecule from the ciliate Tetrahymena thermophila strain B1868VII
Engberg, J. & Nielsen, Henrik, 1990, I: Nucleic Acids Research. 18, 23, s. 6915-9 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Circularization site choice in the self-splicing reaction of the ribosomal RNA intervening sequence of Tetrahymena silvana
Engberg, J., Zaug, A. J. & Nielsen, Henrik, 1988, I: Molecular genetics. Life Science Advances.. 1, s. 50-55 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural characterization of the intron-containing S25 ribosomal protein genes from two Tetrahymena species
Engberg, J., Bojsen, K. & Nielsen, Henrik, 1989, UCLA Symposia on Molecular Biology: Molecular Biology of RNA. Bind 94. s. 145-154 10 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
RRP7A links primary microcephaly to dysfunction of ribosome biogenesis, resorption of primary cilia, and neurogenesis
Farooq, M., Lindbæk, L., Krogh, N., Doganli, C., Keller, C., Mönnich, M., Gonçalves, A. B., Sakthivel, S., Mang, Y., Fatima, A., Andersen, V. S., Hussain, M. S., Eiberg, H., Hansen, L., Kjaer, K. W., Gopalakrishnan, J., Pedersen, L. B., Møllgård, K., Nielsen, H., Baig, S. M. & 3 flere, , 2020, I: Nature Communications. 11, 16 s., 5816.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
8-Methoxypsoralen DNA interstrand cross-linking of the ribosomal RNA genes in Tetrahymena thermophila. Distribution, repair and effect on rRNA synthesis
Fengquin, X., Nielsen, Henrik, Zhen, W. & Nielsen, Peter E., 1993, I: Photochemistry and Photobiology. 58, 2, s. 238-45 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Tetrahymena thermophila acidic ribosomal protein L37 contains an archaebacterial type of C-terminus
Hansen, T. S., Andreasen, P. H., Dreisig, H., Højrup, P., Nielsen, Henrik, Engberg, J. & Kristiansen, K., 1991, I: Gene. 105, 2, s. 143-150 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complex group-I introns in nuclear SSU rDNA of red and green algae: evidence of homing-endonuclease pseudogenes in the Bangiophyceae
Haugen, P., Huss, V. A., Nielsen, Henrik & Johansen, S., 1999, I: Current Genetics. 36, 6, s. 345-53 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Re-assessment of the involvement of snord115 in the serotonin 2c receptor pathway in a genetically relevant mouse model
Hebras, J., Marty, V., Personnaz, J., Mercier, P., Krogh, Nicolai, Nielsen, Henrik, Aguirrebengoa, M., Seitz, H., Pradère, J., Guiard , B. P. & Cavaillé, J., 2020, I: eLife. 9, s. 1-34 34 s., e60862.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Developmental changes of rRNA ribose methylations in the mouse
Hebras, J., Krogh, Nicolai, Marty, V., Nielsen, Henrik & Cavaillé, J., 2020, I: RNA Biology. 17, 1, s. 150-164 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Optimizing RNA structures by sequence extensions using RNAcop
Hecker, N., Christensen-Dalsgaard, M., Seemann, Ernst Stefan, Havgaard, Jakob Hull, Stadler, P. F., Hofacker, I. L., Nielsen, Henrik & Gorodkin, Jan, 2015, I: Nucleic Acids Research. 43, 17, s. 8135-8145 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hver syvende akutte medicinske indlæggelse kan forebygges
Hendriksen, C., Nielsen, Henrik, Jensen, B. N., Perrild, Hans & Jepsen, H. K., 2013, I: Ugeskrift for Læger. 175, 22, s. 1551 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Formidling
- Udgivet
Ribosomal RNA 2′-O-methylation dynamics impact cell fate decisions
Häfner, Sophia Julia, Jansson, Martin David, Altinel, Kübra, Andersen, Kasper Langebjerg, Abay-Nørgaard, Zehra Caldwell, Ménard, Patrice, Fontenas, M., Sørensen, Daniel Madriz, Gay, David Michael, Arendrup, Frederic Schrøder, Tehler, D., Krogh, Nicolai, Nielsen, Henrik, Kraushar, M. L., Kirkeby, Agnete & Lund, Anders H., 2023, I: Developmental Cell. 58, 17, s. 1593-1609.e9Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fetuin and fetuin messenger RNA in granulosa cells of the rat ovary
Høyer, P. E., Terkelsen, O. B., Grete Byskov, A. & Nielsen, Henrik, 2001, I: Biology of Reproduction. 65, 6, s. 1655-62 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Risk stratification in emergency patients by copeptin
Iversen, K., Gøtze, J. P., Dalsgaard, M., Nielsen, Henrik, Boesgaard, S., Bay, M., Kirk, V., Nielsen, O. W. & Køber, Lars Valeur, 2014, I: BMC Medicine. 12, s. 1-10 10 s., 80.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pregnancy associated plasma protein A, a potential marker for vulnerable plaque in patients with non-ST-segment elevation acute coronary syndrome
Iversen, Kasper, Teisner, A. S., Teisner, B., Kliem, A., Thanning, P., Nielsen, Henrik, Clemmensen, P., Grande, P., Iversen, Kasper, Teisner, A. S., Teisner, B., Kliem, A., Thanning, P., Nielsen, H., Clemmensen, P. & Grande, P., 2009, I: Clinical Biochemistry. 42, 9, s. 828-34 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Usefulness of pregnancy-associated plasma protein A in patients with acute coronary syndrome
Iversen, Kasper, Dalsgaard, M., Teisner, A. S., Schoos, M., Teisner, B., Nielsen, Henrik, Clemmensen, P., Grande, P., Iversen, Kasper, Dalsgaard, M., Teisner, A. S., Schoos, M., Teisner, B., Nielsen, H., Clemmensen, P. & Grande, P., 2009, I: American Journal of Cardiology. 104, 11, s. 1465-71 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
SIRT7-Dependent Deacetylation of Fibrillarin Controls Histone H2A Methylation and rRNA Synthesis during the Cell Cycle
Iyer-Bierhoff, A., Krogh, Nicolai, Tessarz, P., Ruppert, T., Nielsen, Henrik & Grummt, I., 2018, I: Cell Reports. 25, 11, s. 2946-2954Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Regulation of translation by site-specific ribosomal RNA methylation
Jansson, Martin David, Häfner, Sophia Julia, Altinel, Kübra, Tehler, D. E., Krogh, Nicolai, Jakobsen, Emil, Andersen, Jens Velde, Andersen, Kasper Langebjerg, Schoof, E., Ménard, Patrice, Nielsen, Henrik & Lund, Anders H., 2021, I: Nature Structural and Molecular Biology. 28, 11, s. 889-899Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Positioning Europe for the EPITRANSCRIPTOMICS challenge
Jantsch, M. F., Quattrone, A., O'Connell, M., Helm, M., Frye, M., Macias-Gonzales, M., Ohman, M., Ameres, S., Willems, L., Fuks, F., Oulas, A., Vanacova, S., Nielsen, H., Bousquet-Antonelli, C., Motorin, Y., Roignant, J-Y., Balatsos, N., Dinnyes, A., Baranov, P., Kelly, V. & 40 flere, , 2018, I: RNA Biology. 15, 6, s. 829-831 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DiGIR1 and NaGIR1: naturally occurring group I-like ribozymes with unique core organization and evolved biological role
Johansen, S., Einvik, C. & Nielsen, Henrik, 2002, I: Biochimie. 84, 9, s. 905-12 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
In vivo expression of a group I intron HEG from the antisense strand of Didymium ribosomal DNA
Johansen, S. D., Vader, A., Sjøttem, E. & Nielsen, Henrik, 2006, I: RNA Biology. 3, 4, s. 157-62 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Expression of protein-coding genes embedded in ribosomal DNA
Johansen, S. D., Haugen, P. & Nielsen, Henrik, 2007, I: Biological Chemistry. 388, 7, s. 679-86 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Northern blotting analysis
Josefsen, K. & Nielsen, Henrik, 1 jan. 2011, Methods in Molecular Biology : RNA: Methods and Protocols. Springer Science+Business Media, Bind 703. s. 87-105 19 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
GPATCH4 regulates rRNA and snRNA 2′-O-methylation in both DHX15-dependent and DHX15-independent manners
Kanwal, N., Krogh, Nicolai, Memet, I., Lemus-Diaz, N., Thomé, C. C., Welp, L. M., Mizi, A., Hackert, P., Papantonis, A., Urlaub, H., Nielsen, Henrik, Bohnsack, K. E. & Bohnsack, M. T., 2024, I: Nucleic Acids Research. 52, 4, s. 1953-1974 22 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Substoichiometric ribose methylations in spliceosomal snRNAs
Krogh, Nicolai, Kongsbak-Wismann, Martin, Geisler, Carsten & Nielsen, Henrik, 2017, I: Organic and Biomolecular Chemistry. 15, 42, s. 8872-8876 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sequencing-based methods for detection and quantitation of ribose methylations in RNA
Krogh, Nicolai & Nielsen, Henrik, 2019, I: Methods. 156, s. 5-15Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Profiling of ribose methylations in ribosomal RNA from diffuse large B-cell lymphoma patients for evaluation of ribosomes as drug targets
Krogh, Nicolai, Asmar, F., Côme, Christophe Roger Michel, Fibiger Munch-Petersen, H., Grønbæk, Kirsten & Nielsen, Henrik, 4 dec. 2020, I: NAR Cancer. 2, 4, 11 s., zcaa035.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RiboMeth-seq: Profiling of 2'-O-Me in RNA
Krogh, Nicolai, Birkedal, U. & Nielsen, Henrik, 2017, RNA Methylation. Springer, Bind 1562. s. 189-209 21 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1562).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Profiling of 2'-O-Me in human rRNA reveals a subset of fractionally modified positions and provides evidence for ribosome heterogeneity
Krogh, Nicolai, Jansson, Martin David, Häfner, Sophia Julia, Tehler, D., Birkedal, U., Christensen-Dalsgaard, M., Lund, Anders H. & Nielsen, Henrik, 19 sep. 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 16, s. 7884-7895Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Lariat capping as a tool to manipulate the 5' end of individual yeast mRNA species in vivo
Krogh, Nicolai, Pietschmann, M., Schmid, M., Jensen, T. H. & Nielsen, Henrik, 2017, I: R N A. 23, 5, s. 683-695 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 3560
Flest downloads
-
207
downloads
RNA 3D modules in genome-wide predictions of RNA 2D structure
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
200
downloads
Positioning Europe for the EPITRANSCRIPTOMICS challenge
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
157
downloads
SIRT7-Dependent Deacetylation of Fibrillarin Controls Histone H2A Methylation and rRNA Synthesis during the Cell Cycle
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet